马甸水利枢纽改建工程的关键词就是“枢纽”两个字。要成为枢纽，就要能灌、能排、能航。要达到这个标准，改建工程需要在现有的基础上，建设抽水站，增设船闸。
在马甸节制闸南边有一座抽水站，建于1973年，用机械来调节内河水位。市水务局总工程师朱雪林介绍，由于当时历史条件限制，抽水站设计标准低，周边建筑物没有配套到位，为恢复马甸抽水站引排功能，经省发改委立项批准，同意恢复马甸抽水站，设计标准是60立方米每秒。
马甸抽水站建成后，可以用机械作业的方式调节内河水位。城区河道禁航后，过船闸船闸也将停用，未来的马甸枢纽将增加船闸功能。市水务局总工程师朱雪林介绍，配套增设的船闸按五级航道标准设计，同时可增设排涝流量为113立方米每秒，项目建成后可大大改善通南地区的灌溉排涝标准。
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